Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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PtprfA2A8L5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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PtprfA2A8L5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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PtprfA2A8L5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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PtprfA2A8L5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PtprfA2A8L5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprfA2A8L5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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