Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms