Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms