Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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