Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms