Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Syngr4Q9Z1L2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms