Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Cldn13Q9Z0S4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Cldn13Q9Z0S4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Cldn13Q9Z0S4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms