Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip2Q9Z0H8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms