Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nek3Q9R0A5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nek3Q9R0A5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nek3Q9R0A5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nek3Q9R0A5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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