Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Mid2Q9QUS6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Mid2Q9QUS6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mid2Q9QUS6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms