Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms