Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xab2Q9DCD2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms