Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Smdt1Q9DB10 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Smdt1Q9DB10 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Smdt1Q9DB10 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smdt1Q9DB10 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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