Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms