Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arpc5lQ9D898 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arpc5lQ9D898 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms