Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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