Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms