Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Tubgcp4Q9D4F8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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