Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms