Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms