Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms