Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms