Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
StambpQ9CQ26 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms