Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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