Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms