Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms