Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms