Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms