Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ciao1Q99KN2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms