Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Smc1bQ920F6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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