Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ubxn4Q8VCH8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn4Q8VCH8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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