Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh10Q8VCH7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms