Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FgbQ8K0E8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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FgbQ8K0E8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FgbQ8K0E8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms