Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rab11fip3Q8CHD8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip3Q8CHD8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip3Q8CHD8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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