Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpcpd1Q8C0L9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms