Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trerf1Q8BXJ2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trerf1Q8BXJ2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trerf1Q8BXJ2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trerf1Q8BXJ2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trerf1Q8BXJ2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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