Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Ctdsp2Q8BX07 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Ctdsp2Q8BX07 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Ctdsp2Q8BX07 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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