Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Smarcal1Q8BJL0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms