Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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