Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnf1Q7TSH7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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