Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms