Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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