Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms