Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6DFW0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6DFW0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms