Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Atg9aQ68FE2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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