Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nlrp9bQ66X22 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp9bQ66X22 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms