Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Scn9aQ62205 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Scn9aQ62205 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Scn9aQ62205 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Scn9aQ62205 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn9aQ62205 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Scn9aQ62205 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Scn9aQ62205 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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