Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim27Q62158 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms