Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sin3bQ62141 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms