Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctr9Q62018 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctr9Q62018 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms